取下腹正中切口进腹。进入腹腔后先探查囊肿的性质，如与大网膜、肠管等有粘连，应先行分离。争取将囊肿完整摘除。以防囊液溢入腹腔。对巨大囊肿难于搬出切口外者，可先用套管针刺入囊肿内，抽吸出部分液体使体积缩小再搬至腹腔外切除。切口周围必须用纱布垫加以保护。
卵巢肿瘤蒂扭转者，因静脉淤血多有血栓形成，为了防止血栓脱落进入血循环，手术中不可立即将蒂松解，而应先将蒂的根部用止血钳夹紧后再松解，然后切除肿瘤。
对小的卵巢囊肿，可行剥除术，保留大部分或部分卵巢。对患有双侧卵巢囊肿者，应尽可能保留卵巢的一些健康组织，以维持其生理功能医学教，育网|搜集整理。
摘除的肿瘤立即剖开检查（必要时及有条件者，应行冰冻切片检查），对有恶性变者，应切除全部子宫及附件，术后作进一步抗癌治疗。
