化脓性脑膜炎的鉴别诊断主要包括以下几个方面：
1.病毒性脑膜炎
起病一般较急，全身感染中毒症状较轻。脑脊液外观多属清亮，细胞数0～数百个，以淋巴细胞为主，糖含量正常，蛋白轻度升高或正常。细菌学检查阴性。
2.结核性脑膜炎
易与经过不规则治疗的化脑混淆。多数起病缓慢，医学教育`网搜集整理常有结核接触史和肺部等处的结核病灶。脑脊液外观呈磨玻璃状，细胞数多<500×106／L，以淋巴细胞为主，糖和氯化物含量降低，蛋白增高。涂片或留膜抗酸染色找到分枝杆菌即可确诊。另外PPD试验有重要参考价值，结核菌培养或动物接种可协助诊断。
3.真菌性脑膜炎
其临床表现、病程及脑脊液改变与结核性脑膜炎相似，起病缓慢，颅压增高，确诊靠脑脊液墨汁染色见到厚荚膜的发亮圆形菌体，在沙氏培养基上可有新型隐球菌生长。
