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细菌人工培养在医学中应用广泛：①在临床上用于细菌感染性疾病的病原学诊断，并可进一步鉴定及深入研究致病菌的生物学性状、遗传变异、耐药性及致病性等；②根据致病菌的药敏感试验结果，指导选择合适的抗菌药物进行治疗；③在生物制品的制备方面，研制预防性菌（疫）苗、类毒素、抗血清等，都需要人工培养细菌；④应用于基因工程技术中，将带有外源性目的基因的重组DNA转化给受体菌（亦称作工程菌），并使其在菌体内表达出特异性蛋白因子（如基因表达干扰素、胰岛素等），或特异性抗原（如基因表达乙型肝炎疫苗）等。
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