1.胞外菌感染：大多数细菌均为胞外菌，当感染机体后，仅存在于吞噬细胞外的体液或组织中，并可引起吞噬细胞死亡和严重的临床症状，称为胞外菌感染。例如，化脓性球菌感染等。
2.胞内菌感染：胞内菌感染系少数细菌，如结核分枝杆菌、麻风分枝杆菌、布鲁氏菌、军团菌等的感染。在临床发病后相当长的时间内，吞噬细胞处于不完全吞噬状态，其清除细菌主要依靠细胞免疫的作用。
3.外毒素致病的免疫特点：产外毒素的致病菌感染，如霍乱弧菌、白喉棒状杆菌和破伤风梭菌等感染，一般仅在黏膜或局部寄生，毒素入血而致病，不引起菌血症；而鼠疫耶尔森氏菌感染，则可引起菌血症，甚至脓毒血症。因此，在临床微生物选择检查方法时，应区别对待。胞外菌感染性疾病的恢复，主要依靠体液免疫，而毒血症主要依靠抗毒素免疫治疗。
