松果体位于丘脑的上后方,两上丘间的浅凹内,以柄附于第三脑室顶的后部,为一椭圆形小体,形似松果,颜色灰红。松果体在儿童期比较发达,一般自7岁后开始退化。成年后松果体部分钙化形成钙斑,可在X线片上见到。临床上可根据其位置的改变,作为诊断颅内病变的参考。
松果体可以合成和分泌褪黑激素melatonin等多种活性物质。这些激素的生理作用并不十分清楚。实验已经证明,可以影响机体的代谢活动、性腺的发育和月经周期等。松果体有病变破坏而功能不足时,可出现性早熟或生殖器官过度发育。相反,若分泌功能过盛,则可导致青春期延长。松果体的内分泌活动与环境的光照有密切关系,呈明显的昼夜周期变化。