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三焦的总体生理功能是通行诸气和运行水液。
三焦是诸气上下运行的通路，肾藏的先天之精所化生的元气，自下而上至胸中，布散于全身；胸中的宗气，自上而下达于脐下，以资先天元气，合为一身之气，皆以三焦为通道。
所谓运行水液，是指三焦为水道。全身水液的输布和排泄，是由肺脾肾等脏的协同作用而完成，但必须以三焦为通道，才能升降出入正常运行。
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