一般以手术治疗为主，内治法与外治法多用于手术前后，以增强体质、减轻症状、控制发展。外科手术是无法避免的，不论是脓疡或是廔管，因为都和直肠相通，粪便与细菌都会持续污染，所以光靠药物保守治疗并无法根治。廔管手术时，除了需对外开口及廔管径处理外，同时对于内开口也一定要加以处理，才能杜绝以后再发的机会。以往的手术常常主张手术时必须做廔管切除才能根治，医.学教育网搜集整理但是切除整个廔管会造成较大的伤口，愈合也需较长的时间，而且肛门括约肌的损害较大。近来多主张廔管切开术，不但对括约肌的损害小，愈合较快、伤口小，而且根治的机会是一样的。
内治：
实证者，宜清热利湿，用二妙丸、萆檞渗湿汤加减。
虚证者，宜养阴清热，用清蒿虌甲汤加减。
外治：
熏洗：却毒汤或苦参汤。
敷药：金黄散或黄连膏外敷局部之红肿。
药捻：用提脓化腐药捻由外口插入引流。
