主要有以下二个原因。
（一）手法不当：除不适当的深刺外，在腹部穴位，反复使用大幅度提插捻转手法，亦可加重症情，造成肠管多处穿孔。有一例右腹股沟嵌顿疝患者，针刺腹部穴位，于留针期间不断施行手法，导致肠穿孔腹膜炎。手术探查中发现，脓疡部位之肠管，均可见有毫针粗细之穿孔，少则一个，多至数个。
（二）进针过深：由于受腹部深似井一说的影响，往往不论病人症情如何，一味深剌。是造成肠穿孔的又一原因。如一女性患者，因腹部疼痛八个月，无肛门排气及排便，由当地医生在上腹部剑突下进行针灸，用长3～5寸的长毫针3枚，剌入深度为2/3针长。当日下午4时，原医学`教育网搜集整理上腹部疼痛转至两下腹部，疼痛加剧并感腹胀。经保守治疗8天，行剖腹探查术，术中发现游离盲肠，并移行至右下腹部，呈逆时针方向扭转320°，盲肠无坏死。小肠普遍扩张，上段回肠可见4×3cm2及2×3cm2之两处坏死穿孔；位置相当于剑突与脐之间，发现中段回肠有两处绿豆大小之圆形穿孔并列，两穿孔相距2cm左右。
