目前尚未找到穴位激光照射反应的确切原因。可能与下列因素有关。
一、照射部位：激光照射反应，多发生于照射头面部穴位或病灶区。无论鼻部、面部、颈项部或眼部都可发生。
二、照射功率与时间：照射功率在2.2～6mW之间，穴位于激光照射反应都有发生，而以4mW以上最为多见。照射时间，则在5～8min（每一穴区）左右，发生率较高。
三、合用其它疗法：穴位激光照射与其它疗法合用时，可出现合并的不良反应。如应用氦-氖激光照射结合外涂补骨脂酊，出现医学教育|网搜集整理涂药区皮肤发红，微肿、水泡、发痒等光毒反应。
微波针刺可能与针刺刺激量及微波幅射量、病人体质与心理因素有关。
