1.医院感染的病原体大多数为人体正常菌群或条件致病菌。这些细菌包括皮肤、消化道、呼吸道及泌尿生殖道的正常菌群。它们对于健康人则无致病性，但对于免疫力低下的人，生态失调的病人则具有高度致病性。

　　2.免疫力低下病人发生的感染中以革兰阴性杆菌较多（占1/2～3/4）。一部分真菌性感染为病人入院前感染的复发。白色念珠菌感染特别容易发生在留置导尿管或血管导管的病人。巨细胞病毒感染常导致肺炎，病死率极高。卡氏肺囊虫不感染健康人，只在免疫力低下的病人中发生感染感染，如艾滋病。

　　3.医院感染的病原菌大多数具有耐药性。在广泛使用抗生素的病房里细菌最容易产生耐药。这些细菌在免疫力低下的病人中常替代正常菌群。往往成为以后发生院内感染的病原体。

　　4.医院感染与储菌所关系：人体最大的储菌所为肠道，其次为鼻咽部。医院环境中适合细菌生长的非生物性储菌所（环境储源）也很多，如水槽、氧气湿化瓶、拖布、潮湿的器材和容器等。许多种医院感染细菌能在体外生长，医.学教育网搜集整理其中有一些细菌还具有耐受消毒剂能力。有人曾做过一个试验，将绿脓杆菌种入新鲜蒸馏水中，经48小时培养发现有繁殖，经蒸馏水传代后的细菌对戊二醛、醋酸、二氧化氯具有抵抗力。储菌所不仅是细菌生长繁殖场所，更重要的是成为细菌基因交换基地，包括耐药性基因及一些与产毒素和侵袭力有关的基因。因此在储菌所居留较久的细菌，不仅会发展成多重耐药菌株，而且也增强了毒力和侵袭性，常常成为医院感染共同来源或持续长期存在的流行菌株。