1.初级溶酶体为除水解酶类外不含其他物质并尚未参与细胞内消化过程的溶酶体，例如中性粒细胞中的嗜天青颗粒、嗜酸性细胞中的颗粒以及巨噬细胞和一些其他细胞中的高尔基小泡。
2.次级溶酶体为除溶酶体的水解酶外尚含有其他外源性或内源性物质并已参与细胞内消化过程的溶酶体，医学教|育网搜集整理亦即含有溶酶体酶的各种噬体，因而称为吞噬溶酶体（phagolysosome），乃由吞噬体与初级或次级溶酶体融合而成。
溶酶体是极为重要的细胞器，能与细胞的一系列生物功能和无数的物质代谢过程。因此，其功能障碍将导致细胞的病理改变，从而在许多疾病的发病机制中具有重要意义。
