突发性公共卫生事件的分类方法有多种，从发生原因上来分，通常可分为：

（一）生物病原体所致疾病：主要指传染病（包括几畜共患传染病）、寄生虫病、地方病区域性流行、暴发流行或出现死亡；预防接种或预防服药后出现群体性异常反应；群体性医院感染等。传染病肆虐人类历史数千年，曾造成世界性巨大灾难，尽管科技进步发明了抗生素及疫苗等药物和生物制剂，使传染病有所控制，但是目前传染病的发病率仍占全世界每年总发病率的第一位，其原因：1、一些被控制的传染病如结核、疟疾等又死灰复燃，卷土重来；2、一系列新传染病相继发现如艾滋病、埃波拉病等人类构成严重威胁；3、特别是第一、第二次世界大战期间和战后某些帝国主义国家，人为研制烈性传染病并用于军事战争，即生物战（或细菌战），给人类带来危害和恐慌。

（二）食物中毒事件：食物中毒是指人摄入了含有生物性、化学性有毒有害物质后或把有毒有害物质当作食物摄人后所出现的非传染性的急性或亚急性疾病，属于食源性疾病的范畴。

（三）有毒有害因素污染造成的群体中毒、出现中毒死亡或危害：这类公共卫生事件由于是污染所致，如水体污染、大气污染、放射污染等，波及范围极广。据统计，全世界每分钟有28人死于环境污染，每年有1472万人因此丧命。并且由于是有毒有害物质所致的污染。常常会对下一代造成极大的危害。

（四）自然灾害：自然灾害如地震、火山爆发、泥石流、台风、洪涝等的突然袭击，会在倾刻间造成大批生命财产的损失、生产停顿、物质短缺，灾民无家可归，眼见几代人为之奋斗创造的和谐生存条件毁于一旦，几十年辛勤劳动成果付之东流，由此而加剧产生种种社会问题，并且还会带来严重的、包括社会心理因素在内的诸多公共卫生问题，从而引发多种疾病，特别是传染性疾病的发生和流行翳学教育网搜集整理。

（五）意外事故引起的死亡：煤矿瓦斯爆炸、飞机坠毁、空袭等重大生产安全事故让我们感到震惊，一些生活意外事故也在严重威胁着人们的安全。这类事件由于没有事前的准备和预兆。往往会造成巨大的经济损失和人员伤亡。

（六）不明原因引起的群体发病或死亡：这类事件由于系不明原因所致，通常危害较前几类要严重的多。一来该类事件的原因不明，公众缺乏相应的防护和治疗知识。同时，日常也没有针对该事件的特定的监测预警系统，使得该类事件常常造成严重的后果。此外，由于原因不明，在控制上也有很大的难度。