1.粘膜组织染色
胃粘膜组织切片，Warthin-Starry法染色或Giemsa染色，HE染色也可，此法检测Hp阳性率高，阳性者表示胃粘膜中有Hp存在。
2.尿素酶快速试验
将胃粘膜活检投入加上指示剂酚红的尿素液中，若胃粘膜有Hp存在，则Hp分泌的尿素酶分解尿素，产生NH3，后者使酚红变成红色，此法简单，阳性则初步判定胃粘膜中有Hp，但需其他方法证实。
3.血清Hp抗体测定
是间接检查Hp感染的方法，阳性表明受试者感染了Hp，但不表示目前仍有Hp存在，不能作为判断幽门螺杆菌根除的检验方法，最适合于流行病学调查。
4.尿素呼吸试验
是一种非侵入性诊断法，口服14C或14C标记的尿素，医学教育|网搜集被胃粘膜上Hp产生的尿素酶水解成CO2从肺排出，阳性表示目前有Hp感染，结果准确。
5.活组织幽门螺杆菌培养（分离培养法）
从胃粘膜活检标本分离培养获得纯菌，再用形态学和生物化学等方法鉴定，这是诊断Hp感染的“金标准”，但要求具有一定的厌氧培养条件和技术，不易作为常规诊断手段推广。
