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（一）概念
指机体某部位正常菌群中各菌种间的平衡被打破，菌种间的比例发生较大幅度变化而超出正常范围的状态。
（二）发生和后果
发生多见于使用抗生素和慢性消耗性疾病等，菌群失调时，多引起二重感染或重叠感染。医学教育|网搜集即在原发感染的治疗中，发生了另一种新致病菌的感染。
（三）菌群失调症概念
当正常菌群在组成和数量上出现明显改变而产生菌群失调时，这种状态进一步发展，机体出现一系列临床病症和体征，称为菌群失调症或菌群交替症。
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