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弧菌、螺菌、占半数的杆菌及少数球菌，由细胞膜伸出菌体外细长的蛋白性丝状体，称为鞭毛。医学教育|网搜集根据鞭毛菌上鞭毛位置和数量，分为单毛菌、双毛菌、丛毛菌和周毛菌。鞭毛是运动器，它使鞭毛菌趋向营养物质而逃避有害物质，且具有抗原性并与致病性有关，例如沙门氏菌的鞭毛抗原即H抗原，具有使菌体穿透肠黏液层侵及肠黏膜上皮细胞的功能。
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