根据细胞壁的不同成份，可分为属、种、型特异抗原。
1．属特异抗原：是衣原体属四种的共同抗原。位于胞壁医|学教育网搜集整理，为脂多糖，类似革兰阴性菌的脂蛋白-脂多糖复合物。用补体结合试验检测。
2．种特异抗原：大多数衣原体的种特异抗原位于主要外膜蛋白上。用补体结合试验和中和试验检测。
3．型特异抗原：为不同亚种的主要外膜蛋白抗原中的特异性成分。型特异性抗原差别的分子基础是由氨基酸可变区的顺序变化决定的。常用检测的方法是单克隆抗体微量免疫荧光试验(MIF)。
4．抗原变异：主要外膜蛋白抗原表位已发生变异，并易形成新的亚种。
