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医师资格考试的合格线由卫生部医师资格考试委员会确定，并于每年的11-12月间向社会公告。2016年医师资格考试医学综合笔试合格分数线公布时间为2016年12月3日，成绩查询入口于12月3日公布。
2016年医师资格考试医学综合笔试合格线分数线（执业医师综合笔试满分为600分，助理医师综合笔试满分为300分）：
| 科目 |
分数线 |
科目 |
分数线 |
| 临床执业医师 |
360 |
临床执业助理医师 |
180 |
| 口腔执业医师 |
360 |
口腔执业助理医师 |
184 |
| 中西医结合执业医师 |
360 |
中西医结合执业助理医师 |
180 |
| 公共卫生执业医师 |
360 |
公共卫生执业助理医师 |
180 |
| 具有规定学历的中医执业医师 |
360 |
具有规定学历的中医执业助理医师 |
180 |
| 师承或确有专长的中医执业医师 |
360 |
师承或确有专长的中医执业助理医师 |
180 |
| 具有规定学历的蒙医执业医师 |
293 |
具有规定学历的蒙医执业助理医师 |
126 |
| 师承或确有专长的蒙医执业医师 |
293 |
师承或确有专长的蒙医执业助理医师 |
126 |
| 具有规定学历的藏医执业医师 |
310 |
具有规定学历的藏医执业助理医师 |
145 |
| 师承或确有专长的藏医执业医师 |
310 |
师承或确有专长的藏医执业助理医师 |
145 |
| 具有规定学历的维医执业医师 |
351 |
具有规定学历的维医执业助理医师 |
163 |
| 师承或确有专长的维医执业医师 |
351 |
师承或确有专长的维医执业助理医师 |
163 |
| 具有规定学历的哈萨克医执业医师 |
199 |
具有规定学历的哈萨克医执业助理医师 |
82 |
| 具有规定学历的壮医执业医师 |
260 |
具有规定学历的壮医执业助理医师 |
122 |
| —— |
—— |
师承或确有专长壮医专业执业助理医师 |
122 |
