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以根入药：何首乌（块根）、牛膝、川牛膝、商陆、银柴胡啊、太子参（块根）、川乌（母根）、草乌（块根）、附子（子根加工品）、白芍、赤芍、防己、板蓝根、地榆、苦参、葛根、粉葛、黄芪、远志、西洋参、白芷、当归、前胡、防风、柴胡、北沙参、秦艽、紫草、黄芩、[医学教育网原创]玄参、地黄（块根）、巴戟天、续断、天花粉、桔梗、党参、南沙参、木香、百部（块根）、麦冬（块根）、天冬（块根）、山麦冬（块根）、郁金（块根）。
以根茎入药：狗脊、绵马贯众（叶柄残基）、黄连、升麻、北豆根、川芎、胡黄连、白术、苍术、延胡索（块茎）、三棱（块茎）、泽泻（块茎）、香附、天南星（块茎）、半夏（块茎）、石菖蒲、川贝母（鳞茎）、浙贝母（鳞茎）、黄精、玉竹、重楼、土茯苓、知母、山药、射干、莪术、姜黄、天麻（块茎）、白及（块茎）。
以根及根茎入药：细辛、大黄、虎杖、威灵仙、山豆根、甘草、人参、红参、三七、羌活、藁本、龙胆、徐长卿、白前、白薇、丹参、茜草、紫菀。
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