五行理论是可以指导中医治疗的，在中医治疗的诸多方面都有着重要的体现。

在确定治疗原则方面，依据五行相生规律确定的治疗原则是“虚则补其母，实则泻其子”。比如肝虚证，根据水生木的相生关系，可通过滋补肾阴（水）来滋养肝木，即“滋水涵木法”，这就是补母的应用；而当出现肝实证时，按照木生火的关系，通过清心火（火）来疏泄肝火，即“泻南补北法”中的泻南，这是泻子的体现。依据五行相克规律确定的治疗原则是“抑强，扶弱”。例如肝气横逆犯脾，导致肝强脾弱，治疗时一方面要抑制肝气的过旺，另一方面要扶助脾气的虚弱，以恢复肝脾之间的平衡，这就是“抑木扶土法”。

在制定治疗方法上，五行理论也有广泛应用。培土生金法，适用于脾气虚弱不能滋养肺脏而致肺脾两虚之证，通过补脾来达到补肺的目的。金水相生法，滋养肺肾阴虚，因为肺属金，肾属水，金能生水，通过滋养肺阴来促进肾阴的生成，或者滋养肾阴来润肺，从而治疗肺肾阴虚之证。

在针灸治疗中，五行理论也有所体现。根据五输穴的五行属性，结合病情的虚实，按照五行相生相克的规律选取穴位进行针刺治疗。如肝实证，可选取属“金”的穴位进行针刺，因为金能克木，以达到泻肝气的目的。

在情志治疗方面，五行理论同样发挥着作用。根据五行相克的关系，怒属木，喜属火，思属土，悲属金，恐属水。可以用一种情志去纠正另一种失常的情志。如“怒胜思”，对于过度思虑而致病的患者，可用激怒的方法来治疗，这是利用了木克土的原理。

综上所述，五行理论贯穿于中医治疗的各个环节，对中医治疗有着重要的指导意义。