以PCR检测病人急性期血清或CSF中Nm的DNA特异片段
D1 目的
应用PCR检查病人急性期血清或CSF中Nm的DNA特异片段,对流脑病人进行早期诊断。
D2 材料
D2.1 疑似流脑患者的CSF或急性期血清。
D2.2 Nm的模板DNA和正常人血清作为对照。
D2.3 4×dNTP。
D2.4 琼脂糖。
D2.5 溴化乙啶。
D2.6 Taq酶(Promega)。
D2.7
引物1为:5'-ATTATTCAGACCGCCGGCAG-3′;
引物2为:5'-CCGATAATCAGGCATCCG-3′。
D2.8 液体石蜡。
D2.9 无菌去离子水。
D2.10 紫外光检测器。
D2.11 PCR扩增仪。
D2.12 10×PCR反应缓冲液[500mmol/L KCl,100mmol/L Tris-HCl,(室温,pH8.3),15mmol/LMgCl2,0.1%(W/V)]明胶。
D2.13 载样缓冲液(0.2%溴酚蓝,50%蔗糖)。
D2.14 1×TBE电泳缓冲液:
0.089m ol/L Tris-H3BO3
0.002mol/L EDTA
D2.15 电泳仪。
D2.16 分子量标准:λDNA-EcoR I/HindⅢ。
D3 扩增程序
在0.5mL Eppendorf管中分别加入:
反应物 加样顺序 体积(μL) 终浓度
10×缓冲液 1 5.0 1×缓冲液
4×dNTP混合物 2 4.0 200μmol/L 每种dNTP
引物1 3 2.5 1μmol/L
引物2 4 2.5 1μmol/L
模板DNA或待检标本 5 5.0 5.0ng DNA/μL
(标本需95℃加热5min预处理)
无菌去离子水 6 30.5
(95℃水浴10min,快速离心30s)
TaqDNA聚合酶 7 0.5 1u
液体石蜡 8 25.0
D3.1 混匀离心,于72℃反应2min后即开始循环。循环参数如下:
94℃变性反应30s;
56℃退火反应30s;
72℃延伸反应60s。
D3.2 30个循环后再72℃延伸4min。
D3.3 反应结束,取出反应管冷至室温后置4℃供检测。
D4 扩增产物的检测
D4.1 取2μL反应产物与1μL载样缓冲液混合。
D4.2 用含溴化乙啶(0.5μg/mL)的1.2%琼脂糖凝胶检测扩增产物。
D4.3 75mm×48mm微型胶,以6V/cm电泳1h,电泳缓冲液为1×TBE。
D4.4 电泳结束后,将凝胶置紫外光检测器上观察结果、照相。
D4.5 扩增产物特异片段的长度为596个碱基对。