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流行性脑脊髓膜炎诊断标准及处理原则——附录D

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  以PCR检测病人急性期血清或CSF中Nm的DNA特异片段

  D1 目的

  应用PCR检查病人急性期血清或CSF中Nm的DNA特异片段,对流脑病人进行早期诊断。

  D2 材料

  D2.1 疑似流脑患者的CSF或急性期血清。

  D2.2 Nm的模板DNA和正常人血清作为对照。

  D2.3 4×dNTP。

  D2.4 琼脂糖。

  D2.5 溴化乙啶。

  D2.6 Taq酶(Promega)。

  D2.7

  引物1为:5'-ATTATTCAGACCGCCGGCAG-3′;

  引物2为:5'-CCGATAATCAGGCATCCG-3′。

  D2.8 液体石蜡。

  D2.9 无菌去离子水。

  D2.10 紫外光检测器。

  D2.11 PCR扩增仪。

  D2.12 10×PCR反应缓冲液[500mmol/L KCl,100mmol/L Tris-HCl,(室温,pH8.3),15mmol/LMgCl2,0.1%(W/V)]明胶。

  D2.13 载样缓冲液(0.2%溴酚蓝,50%蔗糖)。

  D2.14 1×TBE电泳缓冲液:

  0.089m ol/L Tris-H3BO3

  0.002mol/L EDTA

  D2.15 电泳仪。

  D2.16 分子量标准:λDNA-EcoR I/HindⅢ。

  D3 扩增程序

  在0.5mL Eppendorf管中分别加入:

  反应物      加样顺序 体积(μL)   终浓度

  10×缓冲液             1     5.0    1×缓冲液

  4×dNTP混合物            2     4.0    200μmol/L 每种dNTP

  引物1              3     2.5    1μmol/L

  引物2              4     2.5    1μmol/L

  模板DNA或待检标本      5        5.0    5.0ng DNA/μL

  (标本需95℃加热5min预处理)

  无菌去离子水         6      30.5

  (95℃水浴10min,快速离心30s)

  TaqDNA聚合酶           7     0.5 1u

  液体石蜡           8     25.0

  D3.1 混匀离心,于72℃反应2min后即开始循环。循环参数如下:

  94℃变性反应30s;

  56℃退火反应30s;

  72℃延伸反应60s。

  D3.2 30个循环后再72℃延伸4min。

  D3.3 反应结束,取出反应管冷至室温后置4℃供检测。

  D4 扩增产物的检测

  D4.1 取2μL反应产物与1μL载样缓冲液混合。

  D4.2 用含溴化乙啶(0.5μg/mL)的1.2%琼脂糖凝胶检测扩增产物。

  D4.3 75mm×48mm微型胶,以6V/cm电泳1h,电泳缓冲液为1×TBE。

  D4.4 电泳结束后,将凝胶置紫外光检测器上观察结果、照相。

  D4.5 扩增产物特异片段的长度为596个碱基对。

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