祖国医学治疗非淋菌性尿道炎有独到之处，患者可在医生指导下进行治疗。
专方验方
复方六草汤：金钱草、车前草、益母草、旱莲草、淮山药、黄精各30克，灯芯草10扎，甘草5克。
通淋解毒汤：蛇舌草、扁蓄、瞿麦、车前仁、各15克，蒲公英、丹皮、赤芍、猪苓各12克，大黄、黄连、黄柏、甲珠、木通各10克，甘草6克。
中成药
穿心莲片：每次3-5片，每日3次，连服5日，2周为一疗程，适用于湿热下注型。
尿路康冲剂：每次2包，每日3次。
知柏地黄丸：每次10克，每日2次，连服6日停1日，1个月为一疗程，用于肾阴虚型。
外用洗药
苦参30克，大黄30克，银花30克，龙胆草20克，黄柏20克，煎水浸泡外阴。
针灸治疗取足三里、长强、三阴交、气海用毫针针刺，实证用泻法，虚症用补法或平补平泻法。
