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大肠杆菌为人和动物肠道寄生菌之一，它的存在表明，外环境、水和食物为人或动物粪便污染，且污染程度与其数量相关；或间接提示有肠道致病菌污染的可能。大肠菌群数及细菌总数，已列为水、食物和药品的卫生检测指标。我国规定，饮用水的卫生标准为每升水的大肠菌群数不得超过3个，每毫升饮水中，细菌总数不得超过100个。对于食物、饮料和新品亦有相应的规定。
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