球菌大小以直径表示，多为0.5-1.0微米。根据分裂后细胞排列方式的不同进行分类。细胞分裂后，新个体分散而单独存在，是单球菌，如尿素微球菌（Micrococcus ureae）。两个细胞成对排列，是双球菌，如肺炎双球菌（Diplococcus pneumoniae）。经两次分裂形成的四个细胞联在一起呈田字形，是四联球菌，如四联微球菌（Micrococcus tetragenus）。多个细胞排成链状，是链球菌，如乳链球菌（Streptococcus lactis）。细胞沿着三个互相垂直的方向进行分裂，分裂后的8个细胞叠在一起呈魔方状，是八叠球菌，如尿素八叠球菌（Sarcina ureae）。细胞无定向分裂，形成的新个体排列成葡萄串状，是葡萄球菌，如金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）。
