根据酶的组成成份，可分单纯酶和结合酶两类。

　　单纯酶（simple enzyme）是基本组成单位仅为氨基酸的一类酶。它的催化活性仅仅决定于它的蛋白质结构。脲酶、消化道蛋白酶、淀粉酶、酯酶、核糖核酸酶等均属此列。

　　结合酶（conjugated enzyme）的催化活性，除蛋白质部分（酶蛋白apoenzyme）外，还需要非蛋白质的物质，即所谓酶的辅助因子（cofactors），两者结合成的复合物称作全酶（holoenzyme），即：

　　全酶 =酶　蛋　白 +　辅助因子

　　（结合蛋白质） （蛋白质部分） （非蛋白质部分）

　　酶的辅助因子可以是金属离子，也可以是小分子有机化合物。常见酶含有的金属离子有K+、Na+、Mg2+、Cu2+、（或Cu+）、Zn2+和Fe2+（或Fe3+）等。它们或者是酶活性的组成部分；或者是连接底物和酶分子的桥梁；或者在稳定酶蛋白分子构象方面所必需。小分子有机化合物是些化学稳定的小分子物质，其主要作用是在反应中传递电子、质子或一些基团，常可按其与酶蛋白结合的紧密程度不同分成辅酶和辅基两大类。辅酶（coenzyme）与酶蛋白结合疏松，可以用透析或超滤方法除去；辅基（prosthetic group）与酶蛋白结合紧密，不易用透析或超滤方法除去，辅酶和辅基的差别仅仅是它们与酶蛋白结合的牢固程度不同，而无严格的界限。

　　现知大多数维生素（特别是B族维生素）是组成许多酶的辅酶或辅基的成分。它们的化学结构式见生物氧化章。体内酶的种类很多，而辅酶（基）的种类却较少，通常一种酶蛋白只能与一种辅酶结合，成为一种特异的酶，但一种辅酶往往能与不同的酶蛋白结合构成许多种特异性酶。酶蛋白在酶促反应中主要起识别底物的作用，酶促反应的特异性、高效率以及酶对一些理化因素的不稳定性均决定于酶蛋白部分。

　　B族维生素 辅酶形式 主要作用 硫胺素（B1） 硫胺素焦磷酸酯（TPP） α-酮酸氧化脱羧酮基转换作用 硫辛酸 6，8-二硫辛酸 α-酮酸氧化脱羧 泛酸 辅酶A（CoA） 酰基转换作用 核黄素（B2） 黄素单核苷酸（FMN）

　　黄素腺嘌呤二核苷酸（FAD） 氢原子转移

　　氢原子转移 尼克酰胺（PP） 尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD+）

　　尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸（NADP+） 氢原子转移

　　氢原子转移 吡哆素（B6） 磷酸吡哆醛 氨基酸代谢 生物素（H） 生物素 羧化作用 叶酸 四氢叶酸 “一碳基团”转移 钴胺素（B12） 5-甲基钴铵素

　　5-脱氧腺苷钴铵素 甲基转移