混杂偏倚在资料分析阶段也可以通过一定的统计处理方法予以控制。具体方法有：
1.分层分析：
所谓分层分析就是把暴露与未暴露人群或病例与对照放在匀质或较为匀质的范围内进行比较。将研究资料按照混杂因素分层，若各层间研究因素与疾病之间的联系一致，可用Mantel-Haenszel分层分析方法进行分析，得到将该混杂因素调整后的效应估计值。
利用分层分析可定量判断某因素是否为混杂因素。
2.多因素分析：
如果欲控制的混杂因素较多，往往受样本量的影响，分层分析常不适用。在这种情况下，可应用多因素分析方法予以控制，如多元协方差分析，多元Logistic回归分析等等。
