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终毒物与靶分子的交互作用触发毒性效应需考虑以下一个方面：1 靶分子的属性；2 终毒物与靶分子之间反应的类型；3 毒物对靶分子的效应。最后，还必须考虑到，一些并非直接由终毒物与靶分子反应所启动，而是由于生物学微环境改变所引起的毒性。
一、靶分子的属性：实际上所有的内源化合物都是毒物潜在的靶标，然而毒理学上相关的靶标是大分子，如核酸（特别是DNA）和蛋白质。在小分子中，膜脂质最为常见，此外，辅因子如辅酶A和砒哆醛也被涉及。
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