食虫植物的分类都处于不断的变化之中。在克朗奎斯特系统(Cronquist system)中,基于其辐射对称的花朵和特有的捕虫器,茅膏菜科(Droseraceae)和猪笼草科(Nepenthaceae)被归于猪笼草目(Nepenthales)中。瓶子草科(Sarraceniaceae)被归入猪笼草目或瓶子草目(Sarraceniales)中。腺毛草科(Byblidaceae)、土瓶草科(Cephalotaceae)和捕虫幌科(Roridulaceae)被归入虎耳草目(Saxifragales);狸藻科(Lentibulariaceae)被归入玄参目(Scrophulariales),后并入唇形目(Lamiales)。
在更先进的分类系统中,如被子植物种系发生学组(APG,Angiosperm Phylogeny Group)中,科下分类被保留了下来,但它们已被重新划分为几个目。露松属(Drosophyllum)被从茅膏菜科中独立出来,其可能与双钩叶科(Dioncophyllaceae)之间具有密切的联系。
分类如下(只包括食虫属部分),已绝种物种以剑号(†)加注。
双子叶植物
● 菊目(Asterales)
● ● 花柱草科(Stylidiaceae)
● ● ● 花柱草属(Stylidium)
● 石竹目(Caryophyllales)
● ● 双钩叶科(Dioncophyllaceae)
● ● ● 穗叶藤属(Triphyophyllum)
● ● 露叶茅膏菜科(Drosophyllaceae)
● ● ● 露松属(Drosophyllum)
● ● 茅膏菜科(Droseraceae)
● ● ● 貉藻属(Aldrovanda)
● ● ● 捕蝇草属(Dionaea)
● ● ● 茅膏菜属(Drosera)
● ● ● + 茅膏菜花粉属(Droserapollis)
● ● ● + 茅膏菜粉属(Droserapites)
● ● ● + 茅膏菜石属(Droseridites)
● ● ● + 菲氏花粉属(Fischeripollis)
● ● ● + 古貉藻属(Palaeoaldrovanda)
● ● ● + 萨州花粉属(Saxonipollis)
● ● 猪笼草科(Nepenthaceae)
● ● ● ●猪笼草属(Nepenthes)
● 杜鹃花目(Ericales)
● ● 捕虫幌科(Roridulaceae)
● ● ● 捕虫幌属(Roridula)
● ● 瓶子草科(Sarraceniaceae)
● ● ● + 古瓶子草属(Archaeamphora)
● ● ● 瓶子草属(Sarracenia)
● ● ● 眼镜蛇瓶子草属(Darlingtonia)
● ● ● 太阳瓶子草属(Heliamphora)
● 唇形目(Lamiales)
● ● 腺毛草科(Byblidaceae)
● ● ● 腺毛草属(Byblis)
● ● 狸藻科(Lentibulariaceae)
● ● ● 捕虫堇属(Pinguicula)
● ● ● 螺旋狸藻属(Genlisea)
● ● ● 狸藻属(Utricularia)
● ● 角胡麻科(Martyniaceae)
● ● ● 单角胡麻属(Ibicella)
● 酢浆草目(Oxalidales)
● ● 土瓶草科(Cephalotaceae)

食虫凤梨
● ● ● 土瓶草属(Cephalotus)
单子叶植物
● 禾本目(Poales)
● ● 凤梨科(Bromeliaceae)
● ● ● 布罗基凤梨属(Brocchinia)
● ● ● 嘉宝凤梨属(Catopsis)
● ● 谷精草科(Eriocaulaceae)
● ● ● 食虫谷精草属(Paepalanthus)