至少有36个基因定位于MHC-Ⅲ类区内，表达产物主要包括两类，一类是与免疫应答相关的C4、C2、Bf、TNF、HSP70等蛋白分子，可参与炎症和应急反应，与内源性抗原的加工提呈相关。另一类是与免疫无明显关联的缬氨酰tRNA合成酶、类固醇21-羟化酶及一些富含脯氨酸的蛋白质分子医学教.育网搜集整理。
Ⅲ类分子不是表达于细胞表面的膜分子，而是分布于血清及其他体液中的可溶性分子。
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