根据细菌代谢时对分子氧的需要与否，可以分为四类：
①专性需氧菌：具有完善的呼吸酶系统，需要分子氧作为受氢体来完成需氧呼吸，仅能在有氧环境下生长。如结核分枝杆菌、霍乱弧菌。
②微需氧菌：在低氧压（5%-6%）下生长最好，氧浓度>10%对其有抑制作用。如空肠弯曲菌、幽门螺杆菌。
③兼性厌氧菌：兼有需氧呼吸和无氧发酵两种功能，不论在有氧或无氧环境中都能生长。大多数病原菌属于此。
④专性厌氧菌：缺乏完善的呼医`学教育网搜集整理吸酶系统，利用氧以外的其他物质作为受氢体，只能在无氧环境中进行发酵。有游离氧存在时，不但不能利用分子氧，而且还能受其毒害，甚至死亡。如破伤风梭菌、脆弱类杆菌。
