细胞内的各种酶或酶系是集中并隔离于不同的亚细胞区域内的，即酶在细胞内的分布区是区域化的。这样，酶催化的各种类型反应可以在相对独立的空间内进行，互不干扰。但是通过膜的通透性和转运机制，又可以使各个相关的反应能够连续和协调地进行。
如脂肪酸的氧化和合成两个代谢途径分别在线粒体内外不的区域进行就是一个典型的例子。脂肪酸氧化的起始物脂酰CoA存在于细胞液中，它需要经过肉碱脂酰转移酶的作用，才能跨膜进入线粒体基质进行β氧化。而脂肪酸合成的原料乙酰CoA（糖、脂和氨基酸代谢中间产物）则存在于线粒体内，需要在柠檬酸合成酶催化下，医学教.育网搜集整理与草酰乙酸缩合形成柠檬酸，再跨膜转移到细胞胞液中，并释放出乙酰CoA，参与脂肪酸合成。
