孤独症虽尚无特效治疗，但综合治疗对多数患者都有所帮助，其中少数尚可获得明显好转。
行为治疗可用来校正其不良行为，促进其社交行为，增加自信，激发其好奇心。特殊教育、适应行为训练、职业训练、环境安排以及对生活事件处理时给予支持等均对患者有重要帮助。
伴发的精神病性障碍及癫痫等可使用药物治疗。小剂量的氟哌啶醇（例如每天2～10mg）可使患者比较安静，有利于提高行为治疗的疗效。哌甲酯（利他林）可治疗伴有多动症的患儿，亦可使少动的患儿活跃起来。普萘洛尔（心得安）或可乐定（可乐宁）对减轻患儿的冲动、攻击行为有效。有报告，纳曲酮[1.5mg/（kg.d）]有改善情绪、促进交往、减少刻板动作及自伤行为的作用医学`教育网搜集整理。
关心患儿父母的情绪，指导家长正确对待及教育患儿也是十分重要的事。这种小孩症状改善甚慢，治疗者也必须有充分的耐心。
