（1）心神不安，惊悸失眠。常与龙骨相须为用，如桂枝甘草龙骨牡蛎汤。
（2）肝阳上亢，头晕目眩。入肝经，有平肝潜阳，益阴之功。若阴虚阳亢，眩晕耳鸣者，常与龙骨、龟甲、牛膝等同用，如镇肝息风汤；热病日久，灼烁真阴，虚风内动，四肢抽搐者，每与龟甲、鳖甲、生地黄等同用，如大定风珠。
（3）痰核，瘰疠，癥瘕积聚。本品味咸，软坚散结。治痰火郁结之痰核、瘰疠，常与浙贝母、玄参等配伍，如消瘰丸；用治血瘀气结之癥瘕痞块，多与鳖甲、丹参等配伍。
（4）滑脱诸证。医学敎育网搜集整理本品煅后有与龙骨相似的收敛固涩作用。治疗遗精、滑精、遗尿、尿频、崩漏、带下、自汗、盗汗等多种正虚不固，滑脱之证，并配伍相应的补虚药物同用。
此外，锻牡蛎有收敛制酸作用，可治胃痛泛酸。
