根据我国水污染防治法的规定，各级环境保护部门对水污染防治实行统一监督与管理，卫生部门协同环境保护部门实施卫生监督和管理。
（一）开展水体污染与自净调查，要弄清水体污染源、污染性质及污染程度和范围。在对水体进行经常性卫生监测时，应注意监测污染源排放的废水对下游取水点水质的影响。如条件许可应在丰水期、枯水期分别进行水质监测。
（二）对医院污水特别是传染病、结核病医院的污水要加强卫生管理，严格按照医院污水排放标准对其进行处理和消毒，并在技术上给予指导。
（三）对污水灌溉农田或污水养鱼的地区，要定期监测污水水质、土壤中有害物质含量及农产品和鱼类的质量，防止污水灌溉、养鱼而造成健康危害。
（四）协同环境保护部门开展水污染防治的监督和管理。特别是对水体污染源的管理，医学教|育网搜集整理监督厂矿企业认真执行《废水排放标准》，积极参与有可能向水体排放污染物的建设项目的监督管理。
（五）开展经常性卫生监督和管理，要重视资料的收集和管理，及时分析与总结，为修订有关卫生标准提供科学依据。
