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NSAIDs损伤胃肠黏膜的机制包括局部直接作用和系统作用NSAIDs药物具有弱酸性的化学性质溶解后可以释放氢离子破坏胃黏膜屏障
NSAIDs既抑制COX-1，也抑制COX-2.对COX-2的抑制作用为其治疗作用的基础，而对COX-1的抑制作用则成为其不良反应的原因。
例如：胃肠黏膜存在COX-1，催化PGs形成，后者对胃肠黏膜有保护作用。阿司匹林抑制COX-1，干扰PGs（主要为PGE2）合成，刺激胃黏膜，引起上腹不适，胃灼痛，甚至诱发或加重溃疡和出血。大剂量时可刺激延脑催吐化学感受器而引起恶心和呕吐，并可损伤胃黏膜，呈无痛性出血。饭后服药，服用抗酸药或服用肠溶片，或与PGE2同服可减轻或避免胃肠反应。
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