螺旋藻的形态特征：
螺旋藻表面不具无胶质鞘，不易被微生物附着，细胞内有气泡，上浮性好。细胞或藻丝顶部常不尖细，横壁常不明显，顶细胞圆形，外壁不增厚。无异性胞和厚壁胞，可大量繁殖形成水华。
蓝藻类细胞无色素体，色素分布在原生质体外部的色素区，蓝绿色。原生质体内部有一无色的中央区，类似其他藻类的细胞核，但无核仁和核膜，因此螺旋藻属于原核植物。钝顶螺旋藻为丝状体，藻丝螺旋状，无横隔壁，蓝绿色；藻丝宽4～5微米，长400～600微米；藻丝的顶端细胞钝圆，无异形胞。
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