水针疗法的应用范围较广，凡是针灸的适应症大部分都可用本法治疗。
（1）运动系统疾病：痹证（肩周炎、风湿性关节炎）、腰腿痛（腰肌劳损、骨质增生、椎间盘突出）、扭伤等。
（2）神经系统疾病：头痛、不寐、口眼歪斜、痿证、三叉神经痛、坐骨神经痛、肋间神经痛、癫狂痫证等。
（3）消化系统疾病：胃痛（胃下垂、溃疡病、胃肠神经官能症）、腹泻、痢疾等。
（4）呼吸系统疾病：咳嗽（急慢性支气管炎、上呼吸道感染）、哮喘、肺痨等。
（5）心血管病：心悸（心动过速）、心痛（冠心病、心绞痛）、高血压等。
（6）外科、皮肤科疾病：乳痈、肠痈、腹痛（溃疡病穿孔、肠梗阻、胆石证、胆道感染）、淋证（尿路结石）、风疹、痤疮、银屑病等。
（7）五官科疾病：咽喉肿痛、目赤肿痛、中耳炎、鼻炎等。
（8）妇产科、小儿科疾病：阴挺（子宫脱垂、催产；小儿肺炎、小儿腹泻等。
（9）用于外科手术的麻醉：穴位注射施行针麻的在五官科中用的最多，用穴有体穴、耳穴，用药有生理盐水，维生素注射液及洋金花等中药制剂。
