阴阳平衡理论是中医的核心理念之一，认为人体健康的状态是一个动态的阴阳平衡状态。当这种平衡被打破时，就会出现疾病。因此，在中西医内科主治医师的实际工作中，利用阴阳平衡理论指导治疗主要体现在以下几个方面：
1. 诊断阶段：首先要通过望、闻、问、切四诊合参的方法来判断患者体内是否存在阴阳失衡的情况，比如阴虚火旺或阳气不足等，并确定其具体表现形式和程度。
2. 治疗原则：根据患者的体质特点以及病症的性质（寒热虚实），采取相应的调治方法。如对于因阴虚导致的症状，可以使用滋阴降火药物；而对阳衰引起的疾病，则需温补阳气来恢复平衡。
3. 药物选择与配伍：在开具处方时，应考虑药性之间的相互作用及其对人体阴阳的影响。例如，在治疗寒性疾病时，可选用温热性质的药材以助阳散寒；而在处理热症时，则应用清凉性质的药物清热解毒。
4. 生活方式调整：除了药物治疗外，还应当指导患者进行适当的生活习惯改变，如合理饮食、适度运动等，以此来促进体内阴阳和谐。比如，对于阴虚者建议多吃滋阴润燥的食物；而对于阳虚者，则应增加温补性质的食品摄入。
5. 疗效评估与调整治疗方案：在治疗过程中，需要定期观察患者的症状变化及身体状况，并根据实际情况及时调整用药和非药物干预措施，确保达到理想的阴阳平衡状态。

总之，在中西医结合内科主治医师的工作中，运用阴阳平衡理论指导临床实践是一种非常重要的方法。通过准确把握患者体内阴阳失衡的特点，采取针对性的治疗策略，可以有效提高疾病的治愈率并改善患者的生活质量。