原发性肝癌的诊断方法主要包括以下几类：

血清学检查方面，甲胎蛋白（AFP）是诊断原发性肝癌的重要指标。在排除妊娠、生殖腺胚胎瘤等情况后，若AFP大于400μg/L持续4周，或AFP由低浓度逐渐升高不降，或AFP在200μg/L以上的中等水平持续8周，结合影像学检查有肝癌特征性占位性病变，即可做出肝癌的诊断。此外，异常凝血酶原（PIVKA - Ⅱ）、α - L - 岩藻糖苷酶（AFU）等血清标志物也可辅助诊断。

影像学检查是诊断肝癌的关键手段。超声检查是最常用的方法，可显示肝内占位性病变的大小、形态、部位等，能发现直径2cm左右的肿瘤，还可用于引导肝穿刺活检。CT检查具有较高的分辨率，增强扫描能更好地显示肝癌的特征，如动脉期快速强化，门脉期和延迟期强化程度下降等，可发现直径1cm左右的微小肝癌。MRI对软组织分辨能力强，对肝癌的诊断及鉴别诊断有重要价值，特别是对一些CT难以诊断的小肝癌。肝血管造影是一种有创检查，能清晰显示肝内血管情况及肿瘤的血供，对于诊断和介入治疗有重要指导意义。

肝穿刺活检是确诊肝癌的金标准。在超声或CT引导下经皮肝穿刺活检，获取病变组织进行病理检查，可明确肿瘤的病理类型和分化程度，但该检查存在一定的出血、肿瘤种植转移等风险。此外，对于有典型的肝癌临床表现，如肝区疼痛、肝大、消瘦、乏力等，结合患者有乙肝、丙肝等肝病病史，也有助于临床诊断。综合运用这些诊断方法，能够提高原发性肝癌诊断的准确性和早期诊断率。