三焦病证的辨别依据主要基于温病在三焦所属脏腑的病理变化及临床表现。三焦病证是清代医家吴鞠通依据《内经》三焦部位划分概念，结合温病传变规律总结出来的一种辨证方法，具体辨别依据如下。

从症状特点来看，上焦病证主要涉及手太阴肺经和手厥阴心包经的病变。肺主气属卫，若温邪犯肺卫，可见发热、微恶风寒、口微渴、咳嗽等肺卫表热证，是温病初起阶段。若邪热内陷心包，则出现高热、神昏、谵语等神志症状，这是病情较重的表现。中焦病证主要与足阳明胃、足太阴脾的病变有关。阳明主燥，邪入阳明，里热炽盛，会出现身热、面目俱赤、呼吸气粗、便秘、苔黄燥、脉沉实等阳明燥热证。太阴主湿，若湿邪困脾，可见身热不扬、头身困重、胸闷脘痞、泛恶欲吐、苔腻脉濡等湿温病证。下焦病证主要为足少阴肾经和足厥阴肝经的病变。多为温病后期，邪热久羁，耗伤肝肾之阴。肾阴亏虚可见身热面赤、手足心热甚于手足背、口干咽燥、神倦耳聋、脉虚大等；肝阴不足，水不涵木，虚风内动，则见手指蠕动、甚或瘈疭、心中憺憺大动等。

从传变规律来看，三焦病证一般多由上焦开始，自上而下传至中焦，再传至下焦，这是病情由浅入深、由轻到重的一般发展过程。但也有起病即见中焦或下焦病证者，还有上焦病证未罢而又见中焦病证，或中焦病证未愈而出现下焦病证等情况。因此，在辨别三焦病证时，要综合观察症状的变化及传变情况，准确判断病情的轻重、病位的深浅和预后转归，从而为临床治疗提供依据。