菌痢即细菌性痢疾，是由痢疾杆菌引起的肠道传染病，治疗菌痢常用药物主要包括以下几类。

首先是抗生素类药物。喹诺酮类药物是治疗菌痢的常用药物之一，如诺氟沙星、环丙沙星、左氧氟沙星等。这类药物具有广谱抗菌作用，对痢疾杆菌有较强的杀菌作用，口服吸收良好，能有效抑制细菌的DNA旋转酶，阻碍细菌DNA的复制，从而达到治疗目的。但是18岁以下儿童、孕妇及哺乳期妇女禁用。

磺胺类药物，如复方磺胺甲噁唑，它通过抑制细菌的叶酸代谢来发挥抗菌作用。在过去是治疗菌痢的重要药物，但由于近年来耐药菌株增多，应用相对受限，不过对于一些病情较轻且对其敏感的患者仍可使用。

头孢菌素类药物，如头孢曲松、头孢噻肟等。这类药物抗菌谱广，杀菌力强，对痢疾杆菌有较好的抗菌活性，尤其是对耐药菌株也有一定的疗效。而且安全性较高，不良反应相对较少，适用于儿童、孕妇等特殊人群。

此外，黄连素（小檗碱）也是治疗菌痢的常用药物。它是从黄连、黄柏等植物中提取的生物碱，具有抗菌、抗炎、止泻等作用，对痢疾杆菌有一定的抑制作用，且副作用较小，可作为轻症菌痢的治疗选择。

在治疗菌痢时，应根据患者的病情、年龄、药物敏感性等因素综合考虑，合理选择药物。同时，还应注意补充水分和电解质，维持水、电解质平衡，以促进患者的康复。