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同时具备以下三项条件的台湾地区永久居民可申请大陆医师资格：2007年12月31日前取得台湾地区合法行医资格满五年；具有台湾地区专科医师资格证书；目前正在台湾地区医疗机构中执业。相关认定条件及办法同时对香港、澳门地区医师适用。
不具备上述条件的台湾地区永久居民，符合以下条件可申请大陆医师资格考试：在台湾地区取得合法行医资质，其学历经过国家教育部留学服务中心认证的，可以报名参加医师资格考试；在台湾地区未取得合法行医资质，其学历经过国家教育部留学服务中心认证的，应当在大陆三级医院或台湾地区的医院实习期满一年并考核合格，方可报名参加医师资格考试。考试方式、考试内容、合格分数线和收费标准与报考同类别的大陆考生相同，其《医师执业证书》的发放按照有关规定执行。
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