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牙髓
牙髓是疏松结缔组织，其中成纤维细胞称为牙髓细胞。成牙本质细胞位于牙髓周围与前期牙本质相连处。巨噬细胞和未分化的间充质细胞，通常在炎症时发挥作用。能形成第三期牙本质的细胞被称为未分化的间充质细胞、多潜能间质细胞，属于牙髓干细胞，有多向分化的潜能。
牙髓在牙发育完成后，随着年龄的增长不断形成继发性牙本质，出现退行性改变。牙髓内的神经常反应为痛觉，而不能区分冷、热、压力及化学变化，因为牙髓缺乏对这些刺激的感受器，同时还缺乏定位能力，故牙髓炎患者不能准确指出痛牙的部位。牙髓有修复再生的能力，但能力有限。
牙骨质
牙骨质与骨组织的组成相类似，可分为5种类型：无细胞无纤维牙骨质覆盖釉质，无功能。无细胞外源性纤维牙骨质即含牙周膜穿通纤维的牙骨质。有细胞固有纤维牙骨质无牙周膜纤维插入，如修复牙本质缺损的牙骨质。无细胞固有纤维牙骨质形成于对外力的适应性反应。其内不含牙骨质细胞。有细胞混合性分层牙骨质为无细胞外源性纤维牙骨质和有细胞固有纤维牙骨质不规则交替沉积而成，通常分布在根分歧区及根尖区。
牙骨质的组织学结构与密质骨相似，细胞位于陷窝内，并有增生沉积线。细胞间质由纤维和基质构成，主要是蛋白多糖和矿物盐。牙骨质表面有一层刚形成尚未钙化的牙骨质即类牙骨质。牙骨质又分为无细胞牙骨质和细胞牙骨质。无细胞牙骨质：紧贴牙本质表面，自牙颈部到近根尖1/3处。细胞牙骨质：常位于无细胞牙骨质的表面，但在根尖部1/3处可以全部为细胞牙骨质。釉牙骨质界有三种不同情况：约有60%是牙骨质少许覆盖在釉质上；约30%是釉质和牙骨质端端相连；还有10%是两者不相连。在后一种情况下，一旦牙龈萎缩，暴露牙本质即容易发生牙本质过敏。
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