1.由于吸取物小，仍有一定的假阴性，即针吸细胞学阴性的病例不能完全排除恶性，不能完全代替病理组织学诊断。
2.有些病变主要表现为组织结构异常而非细胞异常或高分化恶性肿瘤，此时用本法诊断，准确率不高。
3.虽然可鉴别肿瘤的良，恶性，但本法对某些肿瘤的分型有困难甚至不能分型。
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