由于你没有明确指出“二者”具体是什么，下面我以消化系统常见的胃溃疡和十二指肠溃疡这两种疾病为例，来分析它们诊断方法的区别与联系。

在问诊方面，二者有一定差异。胃溃疡患者的疼痛多在进食后半小时到1小时出现，经1 - 2小时后逐渐缓解，呈现进食 - 疼痛 - 缓解的规律。而十二指肠溃疡患者的疼痛常为空腹痛，多在进食后2 - 4小时出现，疼痛规律为疼痛 - 进食 - 缓解，还可能伴有夜间痛。通过详细询问患者疼痛的发作时间、规律、性质等信息，能为初步判断疾病提供重要线索。

胃镜检查是诊断这两种疾病的重要手段，但在镜下表现有所不同。胃溃疡多发生在胃窦小弯侧，胃镜下可见圆形或椭圆形的溃疡，边缘整齐，底部平坦，覆盖有白色或黄白色苔。十二指肠溃疡则好发于十二指肠球部，溃疡形态与胃溃疡相似，但一般较胃溃疡小且浅。在胃镜检查过程中，还可以取组织进行病理检查，以排除恶性病变。胃溃疡有一定的恶变几率，所以病理检查尤为重要；而十二指肠溃疡恶变极为罕见，但进行病理检查也有助于明确诊断。

X线钡餐检查时，胃溃疡在钡剂充盈相上可显示龛影，周围黏膜皱襞向龛影集中。十二指肠溃疡的龛影通常较小，有时不易显示，但可发现十二指肠球部变形等间接征象。不过，X线钡餐检查的准确性不如胃镜检查。

幽门螺杆菌检测对于两种疾病的诊断和治疗都很关键。因为幽门螺杆菌感染与胃溃疡和十二指肠溃疡的发生密切相关。常用的检测方法包括尿素呼气试验、血清学检测和胃镜下活检组织快速尿素酶试验等。如果检测结果为阳性，在治疗时通常需要进行根除幽门螺杆菌的治疗。

综上所述，胃溃疡和十二指肠溃疡的诊断方法在问诊、镜下表现等方面存在一定区别，但也有很多共同之处，临床医生需要综合各种检查结果进行准确诊断。