伤寒肠道病变以回肠下段集合和孤立淋巴小结的病变最为常见和明显，按病变发展过程可分为以下四期，每期大约持续一周。

第一期是髓样肿胀期，发生于起病的第一周。由于伤寒杆菌的内毒素作用，回肠下段淋巴组织明显肿胀，凸出于黏膜表面，色灰红，质软。其中以集合淋巴小结肿胀最为突出，表面形似脑回样隆起。镜下可见巨噬细胞大量增生，吞噬伤寒杆菌、红细胞、淋巴细胞及细胞碎片，形成伤寒细胞。伤寒细胞聚集成团，形成伤寒小结，是伤寒的特征性病变。

第二期为坏死期，出现在起病的第二周。由于细菌毒素的作用以及伤寒细胞大量增生压迫毛细血管，或因血管内血栓形成，使局部组织缺血，导致髓样肿胀处的肠黏膜发生坏死，坏死组织失去正常光泽，色灰白或被胆汁染成黄绿色。

第三期是溃疡期，在起病的第三周。坏死组织逐渐崩解脱落，形成溃疡。溃疡边缘稍隆起，底部高低不平。集合淋巴小结发生的溃疡呈椭圆形，其长轴与肠的长轴平行。孤立淋巴小结处的溃疡小而圆。溃疡一般深及黏膜下层，严重者可深达肌层及浆膜层，甚至穿孔，如侵及小动脉，可引起肠出血。

第四期为愈合期，相当于起病的第四周。溃疡处坏死组织已完全脱落干净，肉芽组织增生将溃疡填平，然后由溃疡边缘的上皮再生覆盖而愈合。

伤寒肠道病变的这四期发展是一个连续的过程，了解各期特点对于伤寒的诊断、病情观察和治疗具有重要意义。