多肽是由多个氨基酸通过肽键连接而成的化合物，常见的结构主要有一级结构、二级结构、超二级结构、结构域、三级结构和四级结构。

一级结构指的是多肽链中氨基酸的排列顺序，它是多肽最基本的结构，包含了决定多肽高级结构和功能的信息。例如胰岛素的一级结构就决定了它能够与特定受体结合，发挥调节血糖的作用。

二级结构是指多肽链主链原子局部的空间排布，不涉及氨基酸残基侧链的构象。常见的二级结构有α - 螺旋、β - 折叠、β - 转角和无规卷曲。α - 螺旋是多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升，每 3.6 个氨基酸残基螺旋上升一圈，螺距为 0.54nm。β - 折叠是由两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧向聚集，通过链间的氢键连接而成，有平行和反平行两种类型。β - 转角通常由 4 个氨基酸残基组成，使多肽链发生 180°的回折。无规卷曲则是指多肽链中没有确定规律性的那部分结构。

超二级结构是指在多肽链内相邻的二级结构常常在空间折叠中相互靠近、彼此作用，形成规则的二级结构聚集体，如αα、βαβ、ββ等。

结构域是指多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成的相对独立的、近似球状的紧密结构区域，每个结构域都有其独特的功能。

三级结构是指整条多肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是多肽链所有原子在三维空间的排布位置。它是在二级结构、超二级结构和结构域的基础上进一步盘绕、折叠形成的。维持三级结构的作用力主要有疏水作用、离子键、氢键和范德华力等。

四级结构是指由两条或两条以上具有独立三级结构的多肽链通过非共价键相互结合而成的聚合体结构。每条具有独立三级结构的多肽链称为亚基，亚基单独存在时一般没有生物学活性，只有聚合成四级结构才具有完整的生物学功能，如血红蛋白由 4 个亚基组成，具有运输氧气的功能。