在中医学上，运气学说主要是用来推测气候的变化对人体生理病理可能产生的影响，以作为临床诊断和防治疾病时的参考。
一、运气与生理
人与自然界是一个动态变化着的整体。中医学认为，一年四季的气候变化经历着春温、夏热、秋凉、冬寒的规律，它对人体的脏腑、经络、气血、阴阳均有一定的影响。运气运行所形成的正常气候是人类赖以生存的必备条件。人体各组织器官的生命活动，一刻也不能脱离自然条件。人们只有顺从自然的变化，及时地作出适应性的调节，才能保持健康。故曰：“阴阳四时者，万物之终始也，死生之本也，逆之则灾害生，从之则苛疾不起”（《素问·四气调神大论》）。“苍天之气……顺之则阳气固，虽有贼邪，弗能害也，此因时之序”（《素问·生气通天论》）。
人类长期生活在自然之中，形成了自身的生理节律，春夏阳气升发，秋冬阳气潜藏，顺应自然的变化，调节脏腑机能，保持机体内外的阴阳平衡，从而达到防病保健的目的。如人体的气血运行可因四时气候的不同而发生节律性的变化。“天温日明，则人血淖液而卫气浮，故血易泻，气易行；天寒日阴，则人血凝泣而卫气沉。月始生，则血气始精，卫气始行；月郭满，则血气实，肌肉坚；月郭空，则肌肉减，经络虚，卫气去，形独居。是以因天时而调气血也”（《素问·八正神明论》）。从人体水液代谢和调节上，可以看出运气与生理活动的密切关系，“天暑衣厚则腠理开，故汗出……天寒则腠理闭，气湿不行，水下流于膀胱，则为溺与气”（《灵枢·五癃津液别》）。这是人体为适应气候寒热变化而作出的生理反应。
自然界的气候变化，对生物的生长化收藏是必需的条件。但是，如果这些规律反常或变化超越常度，又必然不利于生物的生存、故曰：“风气虽能生万物，亦能害万物，如水能浮舟，亦能覆丹”、《金匮要略·脏腑经络先后病脉症》）。六气合于四时，在正常情况下。能促进力物的生长，若六气太过或不及，就成为六淫，则为致病因素了。当气候顺逆失常时，人们如果不注意摄生，就会引起疾病。所以说：“应则顺，否则逆，逆则变生，变则病”（《素问·六微旨大论》）。所以，人们必须经常保养精神，锻炼身体，增强体质，才能适应气候的变化，保持身体健康而尽终其天年。
二、运气与发病
运气对人体疾病发生的影响，主要包括六气的病因作用、疾病的季节倾向、不同地区气候及天气变化对疾病的影响等。从发病的规律看，由于五运变化，六气变化，运气相合的变化，各有不同的气候，所以对人体发病的影响也不尽相同。
每年气候变化的一般规律是：春风、夏热、长夏湿、秋燥、冬寒。这种变化与发病的关系是：春季肝病较多，夏季心病较多，长夏脾病较多，秋季肺病较多，冬季肾病较多。
从五运来说，木为初运，相当于每年的春季。由于木在天为风，在脏为肝，故每年春季气候变化以风气变化较大，在人体以肝气变化为著，肝病较多为其特点。火为二运，相当于每年的夏季，由于火在天为热，在脏为心，故每年夏季在气候变化以火热变化较大，在人体以心气变化为著，心病较多为其特点。土为三运，相当于每年夏秋之季，由于土在天为湿，在脏为脾，故每年夏秋之间，在气候变化上雨水较多，湿气较重，在人体以脾气变化为著；脾病较多为其特点。金为四运，相当于每年的秋季，由于金在天为燥，在脏为肺，故每年秋季气候变化以燥气变化较大，在人体以肺气变化为著，肺病较多为其特点。水为五运，相当于每年的冬季，由于水在天为寒，在脏为肾，故每年冬季气候比较寒冷，在人体肾气变化为著，肾病、关节疾病较多为其特点。
从六气来说，与五运基本相似。主气的初之气为厥阴风木，·相当于每年的初春，气候变化多风，疾病流行以肝病居多。二之气为少阴君火，相当于每年的暮春初夏，气候逐渐转热，疾病流行以肝心病居多。三之气为少阳相火，相当于每年的夏季，气候炎热，疾病流行以心病、暑病居多。四之气为太阴湿土，相当于每年的暮夏初秋，气候变化以湿气为重，疾病流行以脾病居多。五之气为阳明燥金，相当于每年秋冬之间，气候变化以燥气较重，疾病发生以肺病居多。终之气为太阳寒水，相当于每年的严冬，气候严寒，疾病发生以关节病和感冒居多。
总之，我们可以根据运气中五运六气的变化规律来推测疾病发生的大致情况。
（一）五运与发病
大运有平气、太过和不及之分，其发病情况是：
1.平气之纪与发病：运气的变化既非大过，又非不及，谓之平气之纪。木之平气称敷和之化，其病里急，支满，因肝主筋，故其病宜在筋。火之平气称升明之纪，其病响动，痪疯，因心主血脉，故其病宜在脉。土之平气称备化之纪，其病痞满，因脾主肌肉，故其病宜在肉。金之平气称审平之纪，其病咳嗽，因肺合皮毛，故其病宜在皮毛。水之平气称静顺之纪，其病厥逆，因肾主骨，故其病宜在骨。如《内经》云：“敷和之纪……其病里急支满……升明之纪，其病困痪……备化之纪，其病痞……审平之纪，其病咳……静顺之纪，其病厥”（《素问·五常政大论》）。
2.岁运太过与发病：岁运太过是本运之气亢盛，因而主本气流行致病。
岁木太过：风气通于肝，木运太过，风气大来，脾土受邪，故人病则现泄泻食减、体重烦冤、肠鸣腹支满、吐甚等肝旺东伐中土之候。木运太过，肝气偏盛，故可现忽忽善怒、眩冒巅疾、胁痛等肝本脏受病的症状。
岁火太过：火运太过，火盛为邪，火灼肺金，肺伤则见呼吸少气、咳喘息鸣等症状。正气不足，感受疟邪及暑热之气，邪毒侵人人体而发病。所以火运太过，炎暑流迫，民病疟疾。火气上逆而致咽干，耳聋，两胁、两臂内、胸膺、背、肩胛之间疼痛，胁支满，身热，浸淫，全身骨节疼痛等。若火气独治，再逢少阴、少阳司天，其热尤甚，水源干涸，则谵妄狂越，咳喘息鸣，二便下血不止。
岁土太过：土运太过，脾土偏胜，土胜克水，肾脏受邪，故手足厥冷、忧郁不乐、体重烦冤、腹痛。土气亢盛，脾经自病，故现四肢不举、肌肉萎缩、足痿不行、抽掣拘挛、脚下痛、中满食减。若土胜水衰，木气来复，则现腹满、溏泄、肠鸣、泄泻不止等。
岁金太过：金运太过，肺金偏胜，金胜克木，肝脏受邪，故两胁少腹疼痛、目赤肿痛、眼角溃疡、耳聋等。若金胜木衰，火气来复，则现咳嗽喘促，呼吸困难，肩背痛，以及尻、阴、股、膝、髀、喘、箭、足等处均感疼痛之候。
岁水太过：水运太过，肾水偏胜，水胜克火，故心脏受邪，其病发热、心悸烦躁、四肢厥逆、全身发冷、谵妄、心痛。水邪泛溢，土不能制，则有腹水、足胫浮肿等。若逢太阳寒水之气司天，则病腹满泄泻、饮食不化、口渴、妄冒。
总之，岁运太过，是本运之气太过，因而本气流行。其发病除考虑岁运本身的影响外，还要根据五行生克关系考虑其所胜。
3.岁运不及与发病：岁运不及，则胜运之气流行，主克气大行致病。其发病规律是：
岁木不及：胜运的燥气大行，肺金发病，故见寒热、咳而鼽等。由于“己所不胜侮而乘之。所以本运相应的脏腑被抑！，肝气不足，则见胁、少腹等处疼痛。”己所胜轻而侮之“，木气不及，制土无权，故见中清（内寒）、肠鸣溏泄等病变。岁运不及发病规律还包含着胜气和复气的概念。所谓胜气，指偏胜之气。六气盛衰不常，有所胜则必有所复。所谓复气，指报复之气。如五运中某运偏胜，称为胜气，有所胜必有另一运以报复之，称为复气。胜复的一般规律是凡先有胜，后必有复，以报其胜。如木运不及，金气胜木，木郁生火，火能克金，称为复。木气受制，子气来复，炎暑流火，故现寒热、疮疡、痱疹、痈痤等暑热病。
岁火不及：寒水之气大行，水胜侮土，阴寒凝积，阳气不化，则见胸中痛，胁支满，两胁、膺背肩胛间及两臂内痛，气郁上冒，眼花眩晕，心痛，暴喑，胸腹肿大，胁下与腰背相引而痛，甚则四肢屈不能伸，髋骨与腿之间不能活动自如。若火被水抑，土气来复，则脾失健运，出现大便溏泄，腹中胀满，饮食不下，中寒，肠鸣下注，腹痛，两足拘挛、萎缩麻木不能行走等。
岁土不及：风乃大行，木乘湿土，脾土气衰则现飧泄、霍乱、体重、腹痛、肌肉困动而疼痛。土为木克，金气来复，则肝气不舒，胸胁暴痛波及少腹，呼吸少气而善太息。
岁金不及：火气流行，金衰不能制木，木气旺盛，则病见肩背闷重、鼻塞流涕、喷嚏、大便下血、泄泻急剧等病：金气被制，水气来复，寒气偏胜，阴气厥逆而格拒，则现脑户痛，延及头顶，身体发热，口疮，心痛等。
罗水不及：湿土之气大行，火气亦旺，则病腹胀闷满，身重溏泄，阴性疮疡，脓水稀薄，腰股疼痛，下肢关节运动不利，烦闷抑郁，足痿厥冷，脚下痛，甚至足跗浮肿。若逢太阴司天，寒水在泉，则患下部寒疾，甚则腹满浮肿。水被土抑，木气来复，肝木克土，见面色时变，筋骨拘急疼痛，运动不利，肌肉跳动痉挛，两眼昏花，视觉不明或失常，风疹，心腹痛等。
综上所述，五运太过和不及，由于有本气、胜气、复气的关系，其发病除影响到本脏外，根据五行生克制化的关系，又常关系到所胜和所不胜的脏腑，所谓“气有余，则制己所胜而侮所不胜；其不及，则己所不胜侮而乘之，己所胜轻而侮之，侮反受邪，侮而受邪，寡于畏也”（《素问·五常政大论》），甚至还可波及其所生的脏腑。因此，发病脏腑和病状也各不相同。
（二）六气与发病
六气有主气和客气之分，它对人体疾病的影响也各不相同：
1.主气与发病
主气为一年季节性气候变化的主时之气。在正常情况下，为天之六气，对生物及人本无害而有益。在反常情况下，谓之六淫邪气，是破坏自然气候环境，导致人体发病的重要因素。故曰：“至而至者和。至而不至，来气不及也；未至而至，来气有余也，（《素问·六微旨大论》）。
六气时至而至者谓和平之气，即正常的主时之气。时至而气不至者为该来之气不及，时未至而气至者为该来之气太过，均属于六气的失常。六气失常，如果人体能够适应，就为顺而不病。否则，超过了人体的适应能力，就为逆而生病。故曰：“应则顺，否则逆，逆则变生，变则病”（《素问·六微旨大论》）。“当期为应，愆时为否，天地之气生化不息，无止碍也。不应有而有，是造化之气失常，失常则气变，变常则气血纷挠而为病也。天地变而失常，则万物皆病”（《素问·六微旨大论》王冰注）。
六淫的性质和致病特点各异，·其发病的病变表现亦有不同的特征。
2.客气与发病
六气司天在泉与发病：客气有司天在泉的不同，对人体发病的影响也不一样。对于司天在泉胜气发病，主要是从值年司天在泉上下二气的不同，找出一般的发病规律。推测时，根据该年年支查表，便可知何气司天，何气在泉。司天之气主管上半年，在泉之气主管下半年。何气司天在泉就是何气淫胜发病。三阴三阳司天，六气下临，而人之脏气上应，由于三阴三阳司天在泉不同，自然界六气变化各异，因此引起人体不同的脏器发病。其中也贯穿着五行生克的理论。现将司天在泉之气与人体发病的关系分述如下：
子午之年：为少阴之气司天。少阴君火司上半年之令，热气偏胜，火行其政。因其制己所胜，火旺克金，故以其所胜的肺金病变为主。但是，由于侮反受邪，所以，可见到心本脏的病变，甚至可以影响到生我之脏的肝木，出现胸中烦热，咽干，右胁满，皮肤疼痛，寒热，咳喘，唾血、下血、鼽衄，喷嚏，呕吐，小便变色，甚至疮疡，跗肿，肩背、臂、缺盆等皆痛，心痛，肺部胀满，腹部臌胀而咳喘。其下半年，为阳明在泉之气偏胜，燥淫所胜。由于制其所胜，故以其所胜的肝病为主。但由于侮反受邪及侮所不胜，也可引起肺本脏和心脏发病，出现呕吐苦味、善太息、皮肤面部干枯不泽、足外反热等。
丑未之年：为太阴之气司天。太阴湿土之气主上半年之令。因其制己所胜，故以其所胜的肾水病变为主。但由于侮反受邪，所以还可以见到脾本脏病变，甚至影响到生我之脏的心火，出现跗肿，骨痛阴痹，腰脊头项痛，眩晕，大便难，阴气不用，饥不欲食，咳唾带血，心如悬等。其下半年，为太阳在泉之气所主，寒气偏胜。寒淫于下，肾膀胱自伤，且水旺克火，故还可现心与小肠等脏器的病变，出现少腹疾病，控引睾丸腰脊，上冲心痛，见血，嗌痛颔肿等。
寅申之年：为少阳之气司天。少阳相火之气主上半年之令，火气偏胜，湿热流行。相火淫胜，金受其制，客热内燔，水不能制，故现头痛，发热恶寒而疟，皮肤疼痛，其色黄赤，面身浮肿，腹满仰息，泄泻暴注，赤白痢疾，咳嗽，吐血，烦心，胸中热，鼻衄等。其下半年，为厥阴在泉之气所主。风淫于地，木气有余，脾土受伤，故春病除现心痛支满、两胁里急等肝胆本脏证候外，还可现洒洒振寒，善呻数欠，饮食不下，鬲咽不通，食后呕吐，腹胀噫气，大便疏利或矢气则快然如衰等：
卯酉之年：为阳明之气司天。阳明燥金之气主上半年之令。燥金淫胜，木受其克，故春病在肝胆和肺等，表现为左胁痛，疟，肠鸣注泄鹜溏，心胁暴痛，不可反侧，嗌干面尘，腰痛，男子癫疝，女子少腹痛，眼目昏昧不明，眼角疼痛，疮疡痈疽以及咳嗽痛等。其下半年，为少阴君火之气在泉。热气偏胜，火热内迫，逆乘于肺，侵及中下二焦，故现腹中常鸣，气上冲腹，喘不能立，寒热，皮肤痛，目瞑，齿痛，顺肿，寒热如疟，少腹痛，腹胀大等。
辰戌之年：为太阳之气司天。太阳寒水之气主上半年之令。寒气淫胜，如戊癸化火之运，则水火相激，寒水伤心化热，则现痈疡，厥逆心痛，呕血、下血、衄血，善恐，眩晕欲仆，胸腹满，手热，肘挛腋肿，心中儋儋大动，胸胁胃脘不适，面赤目黄，咽嗌干燥，甚至面黑如始，渴欲饮水等。其下半年，为太阴湿土之气在泉，土胜湿淫，土胜克水，故其病在脾、肾、三焦、膀胱等，表现为饮邪积聚、心痛、耳聋浑浑熔焊、嗌肿喉痹，阴病见血如便血、溺血，少腹肿痛、小便不痛等，头痛、目痛如脱、项部掣痛、腰痛不可回转、胭如结、喘如别等。
巳亥之年：为厥阴之气司天。厥阴风木之气主上半年之令，风气淫胜，木邪乘土，故其；病为风木克脾，土不胜木。表现为胃脘心部疼痛，连及两胁，鬲咽不通，饮食不下，舌本强，食人则呕，冷泄腹胀，便溏泄瘕，小便不通等。其下半年，为少阳相火之气在泉，相火；淫胜，热极生寒，寒热更至，热在下焦则注泄赤白，少腹痛，溺赤，甚则血便。其余诸病与，少阴在泉同候。
综上所述，司天在泉不同，六气变化各异，引起人体脏腑发病也不尽一致。但其发病规律都是用五行生克制化理论来加以说明的。如少阴君火司天，则火灼肺金，多见肺病；阳明燥金在泉，燥气太过，则金气克木，故肝病居多等。此外，六气有胜复之别，对人体脏腑发病的影响也不相同，其规律也是根据五行生克制化理论来制定的。六气盛衰不常，有所胜则必有所复。如，厥阴风木之气太过，木可胜土，土受其制，由于五行相制，金可克木，因此，土气被克过甚的情况下，；金气变成为复气而产生异常。所以，我们不但要考虑到肝病、脾胃病，同时也要考虑到肺病。故曰：“厥阴之胜，此言风木气胜而土受制也……厥阴之复，此言木气先金制而既乃复也”（《世补斋医书》）。
3.客主加临与发病
客主之气彼此是相生的，便相得而安和，气候正常不致为病。如果彼此是相克的，便不相得而为害，气候异常而致病。所谓 “气相得则和，不相得则病”（《素问·五运行大论》）。
由于客主加临的顺逆，也可使疾病有轻重缓急之不同。逆则病情深重，传变迅速，危害甚大；顺则病情轻浅，其势亦缓，其危亦微。故曰：“君位臣则顺，臣位君则逆，逆则其病近，其害速，顺则其病远，其害微”（《素问·六微旨大论》）。
4.运气同化与发病
运气同化，因邪气有轻重，故发病亦有轻重缓急之不同。天符和太乙天符之年，气候专一。易形成太过之气为病；岁会之年，气候多和平？听以天符之年容易发生危重的急性病；太乙天符之年容易出现死亡率极高的暴发性疾病；岁会之年罹病后，多病情轻而病势缓。所以说：“天符为执法，岁会为行令，太乙天符为贵人”。邪之中人奈何，……中执法者，其病速而危；中行令者，其病徐而持；中贵人者，其病暴而死“（《素问·六微旨大论》）。”执隐者位于上，犹执政也。行令者位乎下，犹诸司也。贵人者，统乎上下，犹君主也。……中执法者，犯司天之气也。天者生之本，故其病速而危。中行令者，犯地支之气也，害稍次之，故其病徐而持。持者，邪正相持而吉凶相半也。中贵人者，天地之气皆犯矣，故暴而死“（《类经。运气类》）。
综上所述，我们可以根据运气学说来推测每年气候变化和疾病发生的大致情况。其具体推算方法是：
其一，根据每年的主运主气变化的规律来推测气候变化和发病规律。每年气候变化的一般规律是春风、夏热、长夏湿、秋燥、冬寒。其发病情况是：春季多肝病，夏季多心病，长夏多脾病，秋季多肺病，冬季多肾病。
其二，根据该年的天干确定中运之气，根据地支确定司天在泉之气和客主加临，再找出该年干支的制约关系来确定大运之太过不及和运气同化，最后对上述诸方面进行综合分析，并根据五运和六气的特点来推算出该年的大致发病规律。如庚申年，大运之气为金运太过。
少阳相火司天，厥阴风木在泉。六气的客主加临，一步为主气厥阴风木，客气少阴君火；二步为主气少阴君火，客气太阴湿土；四步为主气太阴湿土，客气阳明燥金；五步为主气阳明燥金，客气太阳寒水；六步为主气太阳寒水，客气厥阴风木。这五步均为客主相生为相得，但因主生客故为逆。第三步为主气少阳相火，客气少阳相火，是客主同气为顺。庚申年值年大运虽为金运太过，但司天之气少阳相火克大运之金气，故为平气之年。综合分析可知：庚申年为平气之年，气候正常或轻微变化，是年不致有大病流行。上半年虽为少阳相火司天，但三步客主加临是客生主，为相得为顺，故气候亦属正常不致为病。下半年为厥阴风木在泉，兼之五六步为主生客为逆，可能出现风淫为病，罹病之后病情较重，病势发展较快。但是，其年运为平气，所以不会造成疾病大流行。
