Jaffé法主要缺点是特异性差，血中丙酮、丙酮酸、叶酸、抗坏血酸、葡萄糖、乙酰乙酸等都能在此反应中呈色，因而被称为“非肌酐色原”，用血清作样品测定时此类物质可占总发色强度的约20%（红细胞中约含50%）。此外，一些头孢类药物如甲氧噻吩头孢菌素也可与苦味酸反应显色而引起正干扰。根据Jaffé反应原理发展出来的动力学方法，基于肌酐和上述非肌酐色原在反应速度上的差异，即后者与苦味酸发生反应比前者要慢，利用这一点来避开非特异反应的干扰（但不能根本消除）。此法干扰和影响因素较少，速度快，适用于自动分析，近年已被普遍采用。近年酶法分析的应用也日渐普及，优点是特异性较好，不必用碱性试剂，更适用于自动分析，但成本较高。
