流感病毒在病毒分类学上属正粘病毒科。它的基因组是分节段的(甲,乙型毒株含8个节段,而丙型仅含7个节段,少一个编码神经氨酸酶蛋白的节段),单链,负链的RNA.甲,乙型毒株基因组至少分别编码10和11种蛋白。由于基因组是分节段的,故易产生同型不同株间基因重配。流感病毒,尤其人甲型流感病毒HA基因能经常不断的发生点突变,导致其编码的HA蛋白分子上氨基酸序列发生替换,造成其抗原性经常不断的发生漂移,每次抗原性漂移常带来不同程度的流感流行。
根据病毒粒核蛋白(NP)和膜蛋白(MP)抗原特性及其基因特性不同医学`教育网搜集整理,把流感病毒分为甲,乙,丙三型。甲型流感病毒根据其表面血凝素(H)和神经氨酸酶(N)蛋白结构及其基因特性又可分成许多亚型,至今甲型流感病毒已发现的血凝素有15个亚型(H1-15),神经氨酸酶有9个亚型(N1-9)。