显微切割技术的特点可以概括为以下四方面：

　　一是“细微”，由于是在显微状态并采用特殊的分离收集手段，显微切割的对象可以达到微米级，显微切割的精度可以达到毫微米级，因此利用显微切割技术可以分离收集到象核仁和包涵体及染色体特异区带这样细微的对象；

　　二是“原位”，利用显微切割技术是在组织细胞或染色体的原位取材，因此所取材料的定位清楚，所研究对象的历史背景明确。例如何杰金氏淋巴瘤中瘤组织成分多样，特征性的瘤细胞（R-S细胞及其变异型）占细胞成分的2%左右，且呈散在性分布，如果常规地用组织匀浆的方式从组织中提取蛋白质或核酸，则既包含了来自瘤细胞的成分，又包含了来自淋巴细胞、浆细胞、中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、组织细胞等多种非瘤细胞的成分，这样所提的蛋白质或核酸来自何种细胞并不清楚，而如果用显微切割技术则可以选择我们需要的细胞，以使研究对象的历史背景明确；

　三是“同质”，显微切割技术可以保证所取材料一定层次上的同质性，例如前面提到的它可以收集CD4或CD8阳性的同质细胞；

　　四是“结合”，显微切割技术可以与多种分子生物学、免疫学及病理学技术结合使用。正是由于显微切割技术具有上述特点或者称为优势，其在分子病理学研究中的应用十分广泛。